Comment utiliser l'IA quand on est Chargé de recherche ?
Prompts et workflows 2026

Tu es un chargé de recherche senior spécialisé en pharmacologie. Conçois un protocole expérimental complet pour évaluer l'efficacité d'un candidat-médicament anti-cancéreux (inhibiteur de tyrosine kinase) sur des lignées cellulaires de cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC). 

Le protocole doit inclure :
1. Objectifs précis et hypothèses de l'étude
2. Matériel biologique : lignée A549 et HCC827 (avec concentrations cellulaires initiales, milieu de culture RPMI avec 10% FBS)
3. Groupe expérimental : contrôle négatif (DMSO 0.1%), contrôle positif (crizotinib 100nM), et 5 concentrations du candidat-médicament (0.01, 0.1, 1, 10, 100 µM)
4. Méthodes : test MTT à 24h/48h/72h, Western blot (cible : EGFR, p-EGFR, AKT, p-AKT, ERK, p-ERK), immunofluorescence
5. Contrôles qualité : triplicates biologiques, témoins positifs/negatifs
6. Analyse statistique : test ANOVA à deux facteurs suivi de Tukey, significativité p<0.05
7. Calendrier expérimental détaillé sur 4 semaines
8. Critères d'arrêt précoces et conditions de terminaison éthique

Précise les concentrations exactes des réactifs, temps d'incubation, température, et équipements nécessaires (microplaque reader, microscope confocal).

Tu es un chargé de recherche en bio-informatique. Analyse les données RNA-seq suivantes (fournies en format TPM) pour comparer le profil d'expression génique entre échantillons traités (n=3) et contrôles (n=3) :

Gènes clés à évaluer : TP53, BCL2, CASP3, PTEN, MYC, CDKN1A, VEGF-A, HIF1A, MMP9, CXCL8

Structure ta réponse ainsi :
1. Normalisation des données : calcul des moyennes ± SD par gène
2. Test statistique : t-test de Student bilatéral avec correction de Benjamini-Hochberg
3. Heatmap simplifié en format texte ( Up = ▲, Down = ▼, NS = ─ )
4. Analyse GO (Gene Ontology) : identification des 3 voies les plus significativement enrichies
5. Interprétation biologique : lien avec le phénotype cellulaire étudié (stress oxydatif)
6. Limites de l'étude et biais potentiels
7. Expériences de validation recommandées (qPCR, knockdown)

Utilise les seuils : Fold Change >1.5 ou <-1.5, p-value ajustée <0.05. Cite les références seminal papers (2019-2024).

Tu es un chargé de recherche en immuno-oncologie. Rédige une introduction de 800 mots (±10%) pour un article scientifique sur les mécanismes de résistance acquise aux inhibiteurs de checkpoint immunitaires (anti-PD-1/PD-L1) dans le mélanome métastatique.

Structure obligatoire :
1. Contexte épidémiologique (paragraphes 1-2) : prévalence du mélanome, taux de réponse initiale aux anti-PD-1 (~40-50%), problème clinique de la résistance secondaire
2. Mécanismes intrinsèques (paragraphes 3-4) : altérations de JAK1/2, mutations de B2M, voies IFN-γ, perte d'expression HLA
3. Mécanismes extrinsèques (paragraphes 5-6) : immunosuppression tumorale (TAM, MDSC, Tregs), altérations du microbiote intestinal
4. Approches thérapeutiques emergentes (paragraphes 7-8) : combinaisons anti-PD-1 + anti-LAG3, modulateurs du microbiote, thérapie cellulaire adoptive
5. Objectifs de l'étude (paragraphe 9) : transition logique vers les résultats

Style : scientifique en anglais (titre Heading 2), citations Vancouver (auteurs, année), 15-20 références récentes (Nat Med, Cancer Cell, JCO 2020-2024), abréviations définies à la première occurrence. Équilibre entre reviews récentes et articles originaux marquants.

Tu es un chargé de recherche en stratégie d'innovation. Réalise une veille concurrentielle approfondie sur le marché des thérapies CAR-T de 3ème génération pour le traitement des lymphomes B.

Format : matrice SWOT + rapport narratif

Entreprises à analyser :
- Gilead/Kite (Yescarta, Brexucabtagene autoleucel)
- Novartis (Kymriah)
- Bristol Myers Squibb (Breyanzi)
- Legend Biotech/J&J (Carvykti)
- Startups émergentes : Caribou Biosciences, Allogene, Beam

Points à investiguer :
1. Technologies proprietary (scFv, co-stimulatory domains, armorization)
2. Pipelines cliniques phase I-III avec dates estiméees
3. Stratégies d'accès au marché et pricing
4. Partenariats académique/industriel
5. Brevets déposés 2022-2024 (mots-clés : 'armored CAR', 'logic gate', 'off-switch')

Analyse croisée :
- Gaps non adressés (toxicités, solid tumors, coût)
- Opportunités pour un acteur académique avec budget limité
- Recommandations de positionnement (cible antigénique, indication, technologie)

Limite : 1500 mots, tableaux synthétiques, graphiques en ASCII. Mise à jour : données disponibles publiquement (press releases, ClinicalTrials.gov, SEC filings).